华侨大学生物医学学院/医学院基因组学研究所简介

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基因组学研究所成立于2014年9月，拥有1000平方米的研发基地和世界先进的第三代单分子测序仪等科研基础设备。现任所长为外专千人计划教授、国家特聘教授Philipp Kapranov教授。

研究所成立两年来已形成基因学功能/转化研究和基因治疗两大主攻方向，以Philipp教授、孙涛教授、肖卫东教授为团队核心，短短两年内聚集了来自美国康奈尔大学、耶鲁大学、天普大学、佛吉尼亚理工大学、瑞典卡罗林斯卡医学院、香港大学、德国萨尔州大学医学院、西班牙圣地亚哥大学、俄罗斯新西伯利亚信息研究所等国内外生物信息学、神经生物学、动物模型实验等跨学科领域的各类高层次人才近十余人。

团队前期研究成果包括高水平文章300余篇，其中团队成员以第一作者或通讯作者在Science、Nature、Cell、PNAS等国际科学研究的顶尖刊物上发表的文章合计30余篇，团队成员入选国家千人、福建省高校领军计划、福建省百人、福建省外专百人团队等多项人才项目，承担多项美国NIH、USDA等重大项目及中国国家自然科学基金项目。

华侨大学基因组研究所分为两个主要研究领域：功能/翻译基因组学和基因治疗。通过基于对转录组的精确和定量分析的系统生物学角度来了解基因组的稳态，发育和疾病。基因组序列在整个生命长度中保持不变，而RNA的成分却变化显著。此外，我们以前发现人类基因组产生大量不编码蛋白质的RNA（非编码RNA），它们通过序列的复杂性以及大量存在代表了人类基因组的主要输出。最近的一项研究表明，非编码RNA在各种细胞过程中起作用，包括调节基因表达，凋亡，DNA修复，染色质调节，先天免疫等等。这类转录物已被证实可介导多种生物过程，从对物种特异性变化的认知到可遗传的染色质变化。同时，已有研究显示这类转录物可用于临床的诊断潜力以及介导药物的作用。越来越多的研究都证明在RNA，特别是非编码RNA方面的研究的重要性，是当今科研界的研究热点，可应用于基础科学，转化研究和临床工作。

精确的RNA定量测量是该研究所转录组研究的基础，基因组学研究所拥有基于Helicos平台的最先进的单分子测序仪。这种分子计数技术具有最低的技术误差 - 这是RNA可重复检测的关键。尤其适用于检测在典型实验中可能占优势的低倍数变化的转录物。

Institute of Genomics at Huaqiao University has two main research areas: functional/translational genomics and gene therapy. The conceptual basis of our genomics work is to understand homeostasis, development and disease via Systems Biology based on accurate and quantitative analysis of transcriptome. The genome sequence stays the same during the entire life while RNA composition changes dramatically. In addition, we previously discovered that human genome produces a vast numbers of RNAs that do not encode proteins (non-coding RNAs) and they represent the major output of our genome by sequence complexity and mass. A largebody of recent research has shown that non-coding RNAs function in various cellular processes, including regulation of gene expression, apoptosis, DNA repair, chromatin regulation, innate immunity and many others. This class of transcripts has been shown to mediate processes as diverse as species-specific changes in cognition to heritable chromatin change. Finally, these transcripts were shown to offer superior diagnostic potential and mediate effect of pharmaceuticals. All these considerations underscoreour research interestsin RNA, especially non-coding RNA, for basic science, translational research and clinical endeavors.

Precise quantitative measurements of RNAs lay at the foundation of the transcriptome research at theInstitute in a form of the state of the art single molecule sequencing machine based on the Helicos platform. This molecule counting technologyhas the lowest amount of technical variation - key to the reproducible detection of RNA. The latter is especially true for detection of transcripts with low fold change that can predominate in a typical experiment.